臨牀消化器内科 Vol.34 No.6(4-3)


特集名 リンチ症候群と遺伝性消化管ポリポーシス
題名 遺伝学的検査とその臨床応用 (3) 遺伝子パネルを用いた遺伝性腫瘍の遺伝学的検査
発刊年月 2019年 06月
著者 後藤 政広 国立がん研究センター研究所臨床ゲノム解析部門
著者 吉田 輝彦 国立がん研究センター研究所臨床ゲノム解析部門/国立がん研究センター中央病院遺伝子診療部門
【 要旨 】 多遺伝子を同時に検査することが可能な遺伝子パネル検査は,有用な遺伝学的検査である.独自に設計した生殖細胞系列の遺伝子パネルNCC oncopanel_FC (for Familial Cancer) は,想定されるさまざまな遺伝性腫瘍の原因となる遺伝子変異(バリアント)を検出するために,各種ガイドラインで言及されているがん関連遺伝子より選出した147遺伝子の検査が可能である.エキスパートパネルによりバリアントの臨床的意義付けがなされた解析結果は,遺伝相談外来担当医に研究結果として報告されている.また,AMEDの臨床ゲノム情報統合データベースMGeNDにも登録され,日本国内の遺伝性腫瘍における遺伝子型・表現型関連を解明するデータとしての利用も期待される.
Theme Lynch Syndrome and Hereditary Polyposis Syndromes
Title Screening of Hereditary Cancer Syndromes Using Germline Multigene Panel
Author Masahiro Gotoh Department of Clinical Genomics, National Cancer Center Research Institute, National Cancer Center Hospital
Author Teruhiko Yoshida Department of Clinical Genomics, National Cancer Center Research Institute, National Cancer Center Hospital / Genetic Medicine and Services, National Cancer Center Hospital
[ Summary ] In order to screen multiple types of hereditary cancer syndromes, a germline multigene test, named NCC oncopanel_FC (for Familial Cancer), has been designed in our laboratory. Based on several clinical guidelines such as the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) and the National Comprehensive Cancer Network (NCCN), 147 causative genes were selected for this test. After analyzing the sequencing data using the csDAI system, which was developed in collaboration with a biotechnology company, the clinical significance of rare variants was rated by an expert panel using the ACMG/Association for Molecular Pathology (AMP) 2015 classification. The research results were reported to physicians in genetic counseling outpatient clinics and registered in a public variant database (Medical Genomics Japan Variant Database (MGeND)) that is supported by the Japan Agency for Medical Research and Development (AMED). It is important to accumulate and share the Japanese variant data along with accompanying clinical information to clarify genotype‒phenotype relationships in hereditary cancer syndromes not only for diagnostic purposes, but also to investigate hereditary cancer syndromes.
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