INTESTINE Vol.21 No.4(1-1)


特集名 腸内細菌をめぐって
題名 腸内細菌をめぐる基礎研究のブレイクスルー(1)腸内マイクロバイオームの網羅的解析法
発刊年月 2017年 07月
著者 須田 亙 慶應義塾大学医学部微生物学免疫学教室/理化学研究所統合生命医科学研究センター(IMS)マイクロバイオーム研究チーム
著者 服部 正平 早稲田大学理工学術院先進理工学研究科/理化学研究所統合生命医科学研究センター(IMS)マイクロバイオーム研究チーム
【 要旨 】 近年のDNAシークエンシング技術の革新的進歩により,数百兆個の細菌から構成される複雑なヒト腸内細菌叢の集合ゲノム(マイクロバイオーム)の網羅的な解析が可能となった.その結果,ヒト腸内細菌叢の生態や機能の全体像が俯瞰され,その変容(dysbiosis)がさまざまな疾患と密接な関係にあることが明らかになってきた.本稿では,次世代シークエンサーを用いた腸内細菌叢の生態および機能を網羅する解析技術について解説する.
Theme Impacts of intestinal microbiota
Title Methods for comprehensive analysis of human gut microbiomes
Author Wataru Suda Department of Microbiology and Immunology, Keio University School of Medicine / Laboratory for Microbiome Sciences, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences (IMS)
Author Masahira Hattori Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University / Laboratory for Microbiome Sciences, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences (IMS)
[ Summary ] Analysis of the human gut microbiome, collective genomes of over 100 trillion intestinal microbial cells which form a complex bacterial community, has recently become more practical due to remarkable advances in sequencing technologies. Metagenomic approaches using next-generation sequencing (NGS) have enabled us to comprehensively analyze genes/functions and species composition in the human gut microbiome, strongly suggesting that the human gut microbiome has profound influences on various host physiologies including disease. We describe the analytical process of metagenomic data generated from NGS for characterization of the ecological and functional features of human gut microbiomes.
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